Il Parco collabora con numerose Università fin dalla sua istituzione.
Le attività portate avanti congiuntamente riguardano sia la formazione, sia la ricerca, sia la realizzazione di progetti.
Il rapporto è particolarmente intenso con gli Atenei della Regione Friuli Venezia Giulia (Udine e Trieste).
Con l’Università di Udine è stata stipulata ad inizio 2008 una specifica convenzione quadro finalizzata alla realizzazione di tesi di laurea, svolgimento di attività di formazione e tirocinio, sperimentazione e ricerca, realizzazione di progetti comuni e organizzazione di eventi.
Dal 2008 il Parco indice un bando per premiare le tesi di laurea più meritevoli concernenti l’approfondimento di aspetti relativi al Parco, al suo territorio ed alle sue specificità, nei settori più vari: dalla conservazione della natura all’economia, dall’agricoltura alla cultura, dalla gestione all’informatica.